解放军医学杂志

北大核心,CA,JST,Pж(AJ),CSCD

国内刊号:11-1056/R

国际刊号:0577-7402

解放军医学杂志2023年第9期:汉滩病毒糖蛋白Gn的T细胞表位预测及其跨种属验证

发布日期:

作者:孙报增,秦聪聪,张俊琦,王永凯,张文标,刘瑞波,白天原,张志辉,张宇丝,杨琨,姜东伯,

单位:1空军军医大学基础医学院免疫学教研室,陕西西安 710032 2空军军医大学基础医学院生物武器损伤防治药物重点实验室,陕西西安 710032 3空军医科大学唐都医院风湿科,陕西西安 710032 4空军军医大学基础医学院微生物学教研室,陕西西安 710032

关键词:汉滩病毒,糖蛋白,表位,计算机预测,免疫反应性

基金:General Program of National Natural Science Foundation of China(82073154);国家自然科学基金面上项目(82073154);Youth Program of National Natural Science Foundation of China(82203510);国家自然科学基金青年项目(82203510);Promotion Program of Air Force Medical University(2020XXXX

目的 筛选、鉴定并验证汉滩病毒(HTNV)包膜糖蛋白-N末端(Gn)上的免疫反应性表位。方法 通过UniProt数据库获取HTNV 76-118株Gn蛋白序列。采用IEDB、SMMPMBEC、NetMHCpan 4.1、SYFPEITHI、Rankpep算法预测表位亲和力,VaxiJen v2.0分析免疫原性,Blastp工具计算保守性,HPEPDOCK和EpiDOCK模拟pMHC对接,TBtools进行双向聚类分析,酶联免疫斑点(ELISpot)实验评价表位细胞免疫反应性。结果 通过UniProt数据库获得了HTNV76-118株Gn蛋白序列(PRO_0000036816)。整合5种亲和力算法,在小鼠H-2亚型中获得了61个优势表位,在人主要组织相容性复合物(MHC)-Ⅰ亚型中得到234个优势表位,MHC-Ⅱ亚型中得到212个优势表位;VaxiJen筛选分别获得H-2、MHC-Ⅰ、MHC-Ⅱ亚型强免疫原性优势表位23、110、42个;进一步采用Blastp筛选获得高亲和力、强免疫原性、种间种内保守的MHC-Ⅰ类限制性表位3个,MHC-Ⅱ类限制性表位81个。双向分层聚类分析揭示了小鼠H2-d、H2-b和部分人类白细胞分化抗原(HLA)在提呈HTNV Gn表位上的相似性。ELISpot验证了5个表位具有较强的诱导脾细胞分泌γ干扰素(IFN-γ)的能力。结论 预测并验证了HTNV Gn上的细胞免疫反应性表位,证实在MHC提呈中病毒抗原存在跨基因、种属、物种的交叉免疫反应性,为预防肾综合征出血热(HFRS)提供了新思路。

来源:2023年第9期

《解放军医学》期刊编辑部

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